Мускатный орех имеет очень ароматный и острый вкус с приятным сладковато-горьким и слегка жгучим оттенком. Мускатный орех должен придавать своеобразие пище, не подавляя ее вкус. Поэтому специю следует использовать в ограниченных количествах и добавлять непосредственно перед подачей блюда на стол.
Мускатный орех придает своеобразие вкусу соусов, рагу, пирогов, а также блюд из картофеля, яиц и сыра. Это незаменимый ингредиент рождественского печенья и пряников.